ちょうどWindowsの移行をしておりましたので若干さだかではありませんが。。
MT4 Build735 のバージョンアップでまたまたインジ等々のフォルダの場所が変わっている模様。
今までは、プログラムファイルがあるフォルダにMQL4というフォルダができていましたが、
個人設定のフォルダに移動しています。
Windows 7(Vistaも??)
C:\Users\xxxxxx\AppData\Roaming\MetaQuotes\Terminal\(アルファベット羅列名フォルダ)
Windows XP
C:\Documents and Settings\xxxxxx\Application Data\MetaQuotes\MetaTrader 4 Terminal\(アルファベット羅列名フォルダ)
見ただけでは分かりませんので、ターミナルを起動し。。
ファイル>データフォルダを開く
でどこのフォルダか確認しないといけません。
MT4を複数インストールしている場合などは、どれがどれだか。。
アップデートは、自動的にコピーするでしょうが、以降EAやインジをインストールする場合、
フォルダに気をつけないと稼動しないでしょう。。